Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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CCDC6Q16204 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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CCDC6Q16204 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC6Q16204 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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