Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 STXBP5L-201ENST00000273666 9496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PMCHL1Q16048 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 UMODL1-205ENST00000408910 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PMCHL1Q16048 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms