Protein–RNA interactions for Protein: Q15772

SPEG, Striated muscle preferentially expressed protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 3,267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEGQ15772 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SPEGQ15772 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPEGQ15772 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPEGQ15772 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPEGQ15772 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPEGQ15772 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPEGQ15772 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPEGQ15772 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPEGQ15772 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPEGQ15772 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPEGQ15772 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPEGQ15772 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPEGQ15772 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SPEGQ15772 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPEGQ15772 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SPEGQ15772 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SPEGQ15772 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms