Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
IRF4Q15306 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
IRF4Q15306 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms