Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRKQ15262 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
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