Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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HERC3Q15034 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HERC3Q15034 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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