Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PCLAFQ15004 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms