Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
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RAB39AQ14964 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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RAB39AQ14964 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
RAB39AQ14964 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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RAB39AQ14964 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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RAB39AQ14964 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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RAB39AQ14964 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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RAB39AQ14964 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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RAB39AQ14964 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RAB39AQ14964 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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