Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATP1A4Q13733 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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