Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PTPN13Q12923 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
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