Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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LTBQ06643 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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LTBQ06643 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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LTBQ06643 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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LTBQ06643 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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LTBQ06643 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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LTBQ06643 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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LTBQ06643 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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LTBQ06643 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LTBQ06643 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LTBQ06643 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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