Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms