Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
DEFA6Q01524 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
DEFA6Q01524 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms