Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTBP60709 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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ACTBP60709 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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ACTBP60709 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ACTBP60709 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ACTBP60709 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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