Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
UBASH3AP57075 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms