Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
ELLP55199 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ELLP55199 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ELLP55199 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ELLP55199 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ELLP55199 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ELLP55199 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ELLP55199 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ELLP55199 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ELLP55199 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ELLP55199 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ELLP55199 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ELLP55199 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ELLP55199 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ELLP55199 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ELLP55199 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ELLP55199 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ELLP55199 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ELLP55199 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ELLP55199 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ELLP55199 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ELLP55199 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ELLP55199 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ELLP55199 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ELLP55199 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ELLP55199 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms