Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FNTAP49354 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FNTAP49354 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FNTAP49354 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FNTAP49354 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FNTAP49354 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FNTAP49354 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FNTAP49354 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FNTAP49354 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms