Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCR5P32302 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CXCR5P32302 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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