Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 HIST1H3B-201ENST00000621411 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AC008536.3-201ENST00000623282 1599 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 PRR13-209ENST00000549924 625 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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