Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRAP18433 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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PTPRAP18433 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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PTPRAP18433 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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PTPRAP18433 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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PTPRAP18433 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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PTPRAP18433 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRAP18433 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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