Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VCLP18206 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VCLP18206 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VCLP18206 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VCLP18206 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VCLP18206 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
VCLP18206 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VCLP18206 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VCLP18206 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VCLP18206 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VCLP18206 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms