Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARF4P18085 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARF4P18085 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF4P18085 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF4P18085 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF4P18085 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF4P18085 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF4P18085 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF4P18085 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF4P18085 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF4P18085 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF4P18085 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF4P18085 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF4P18085 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF4P18085 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF4P18085 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF4P18085 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF4P18085 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF4P18085 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF4P18085 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF4P18085 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF4P18085 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF4P18085 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF4P18085 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARF4P18085 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms