Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
CD28P10747 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
CD28P10747 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms