Protein–RNA interactions for Protein: P10619

CTSA, Lysosomal protective protein, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSAP10619 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSAP10619 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSAP10619 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSAP10619 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSAP10619 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSAP10619 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSAP10619 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSAP10619 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSAP10619 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSAP10619 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSAP10619 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSAP10619 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSAP10619 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSAP10619 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSAP10619 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSAP10619 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSAP10619 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSAP10619 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSAP10619 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTSAP10619 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTSAP10619 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTSAP10619 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms