Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VIL1P09327 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VIL1P09327 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VIL1P09327 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VIL1P09327 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VIL1P09327 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VIL1P09327 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VIL1P09327 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VIL1P09327 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VIL1P09327 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VIL1P09327 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VIL1P09327 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VIL1P09327 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VIL1P09327 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VIL1P09327 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VIL1P09327 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VIL1P09327 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VIL1P09327 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VIL1P09327 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VIL1P09327 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VIL1P09327 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VIL1P09327 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VIL1P09327 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VIL1P09327 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VIL1P09327 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VIL1P09327 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VIL1P09327 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VIL1P09327 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VIL1P09327 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VIL1P09327 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VIL1P09327 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VIL1P09327 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VIL1P09327 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VIL1P09327 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VIL1P09327 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VIL1P09327 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VIL1P09327 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VIL1P09327 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VIL1P09327 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
VIL1P09327 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VIL1P09327 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VIL1P09327 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VIL1P09327 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VIL1P09327 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VIL1P09327 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VIL1P09327 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VIL1P09327 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VIL1P09327 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VIL1P09327 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VIL1P09327 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VIL1P09327 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VIL1P09327 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VIL1P09327 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VIL1P09327 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VIL1P09327 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VIL1P09327 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VIL1P09327 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VIL1P09327 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VIL1P09327 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VIL1P09327 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms