Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJB6O95452 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJB6O95452 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJB6O95452 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJB6O95452 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJB6O95452 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJB6O95452 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJB6O95452 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJB6O95452 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJB6O95452 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJB6O95452 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJB6O95452 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJB6O95452 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJB6O95452 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJB6O95452 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJB6O95452 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJB6O95452 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJB6O95452 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJB6O95452 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJB6O95452 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJB6O95452 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJB6O95452 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJB6O95452 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJB6O95452 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJB6O95452 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJB6O95452 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJB6O95452 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJB6O95452 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJB6O95452 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJB6O95452 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJB6O95452 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJB6O95452 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJB6O95452 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJB6O95452 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJB6O95452 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJB6O95452 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJB6O95452 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJB6O95452 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GJB6O95452 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJB6O95452 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJB6O95452 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJB6O95452 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJB6O95452 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GJB6O95452 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJB6O95452 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms