Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TO15178 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TO15178 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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