Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
EBAG9O00559 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms