Protein–RNA interactions for Protein: A6NFY4

NEMP2, Nuclear envelope integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMP2A6NFY4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NEMP2A6NFY4 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NEMP2A6NFY4 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms