Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms