Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GIT1Q9Y2X7 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms