Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC8Q9Y2L5 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms