Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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XCL2Q9UBD3 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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XCL2Q9UBD3 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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XCL2Q9UBD3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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XCL2Q9UBD3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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XCL2Q9UBD3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
XCL2Q9UBD3 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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