Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MBD5Q9P267 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms