Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L2

MARK1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK1Q9P0L2 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MARK1Q9P0L2 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms