Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NKIRAS1Q9NYS0 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms