Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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ELL3Q9HB65 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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ELL3Q9HB65 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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ELL3Q9HB65 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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ELL3Q9HB65 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ELL3Q9HB65 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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