Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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TRIM8Q9BZR9 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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TRIM8Q9BZR9 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TRIM8Q9BZR9 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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