Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NIFKQ9BYG3 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms