Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HIRIP3Q9BW71 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms