Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CNPPD1Q9BV87 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms