Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RTKNQ9BST9 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms