Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CDK5RAP3Q96JB5 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms