Protein–RNA interactions for Protein: Q96IL0

APOPT1, Apoptogenic protein 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOPT1Q96IL0 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
APOPT1Q96IL0 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
APOPT1Q96IL0 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms