Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
RNF185Q96GF1 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms