Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTP4Q96DX8 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms