Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBA3Q8TBC4 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
UBA3Q8TBC4 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBA3Q8TBC4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBA3Q8TBC4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBA3Q8TBC4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBA3Q8TBC4 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBA3Q8TBC4 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBA3Q8TBC4 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBA3Q8TBC4 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBA3Q8TBC4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UBA3Q8TBC4 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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