Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFAP61Q8NHU2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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