Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW19

APLF, Aprataxin and PNK-like factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLFQ8IW19 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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APLFQ8IW19 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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APLFQ8IW19 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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APLFQ8IW19 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
APLFQ8IW19 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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