Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HAPLN4Q86UW8 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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